北京兒童醫院精神科主要服務對象為18歲以下的兒童和青少年，包括精神疾病診室、心理室、心理訪談室、心理測量室、物理室、沙盤室、生物反饋室、壓力與情緒管理室、行為觀察室、科學研究室等。
北京兒童醫院精神科目前已開設如下專業細分門診：注意缺陷多動門診、孤獨多動抽動門診、學習困難門診、心理咨詢門診、青春期心理咨詢門診、精神病專病門診、精神殘疾評估門診、腦功能及行為發育門診、腦認知功能評估門診、心身會診聯絡門診等。
北京兒童醫院先后獲得“全國文明單位”“首都文明單位標兵”“首都文明服務示范窗口”“專科醫院”“雙十佳人民滿意醫院”“北京蕞受歡迎三甲醫院”榮譽稱號及“首都勞動獎狀”“全國五一勞動獎狀”。
在國內率先開展了兒童正常腦發育和神經障礙性疾病的多模態磁共振研究,首次利用酰胺質子轉移成像和磁化轉移成像技術發現兒童腦白質的游離蛋白含量隨著腦發育進程逐漸減低,提出APT成像技術可以用來監測兒童的髓鞘化形成過程。2012年1月提出腦認知功能癱瘓概念(認知癱, Cognitive palsy, CP)，是繼Kanner之后對腦認知的重大推進。這是一個全新的精神病理學概念。目前正利用彌散張量磁共振成像技術建立0-2歲嬰幼兒腦白質模板,以填充和彌補人類腦計劃中嬰幼兒腦發育的空白?
