曾學軍教授參與了國內目前所有關于痛風和高尿酸血癥指南的制定工作， 2013 年牽頭制定了《高尿酸血癥社區管理規范草案》，2018年11月在中華全科醫師雜志上發表修訂版《高尿酸血癥社區管理流程的專家建議》，2020年4月再次牽頭制定《痛風及高尿酸血癥基層診療指南》。
在醫療實踐的同時，曾學軍教授致力于臨床醫學教育，任美國內科醫師學會（ACP）Fellow、美國醫學研究所（IOM）中國醫學教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎、 “住院醫師心中好老師”、北京市師德先進個人、北京協和醫學院教學名師等榮譽，帶領普通內科獲得2015年北京協和醫學院教學團隊稱號。2019年2月入選十大社區健康促進首 席專家。
北京協和醫院風濕免疫科從建科時僅有3張病床的小科室發展到今天，協和風濕免疫科已擁有68張病床，年收治患者1500例次以上，年門診量逾12萬人次，不僅注重系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕關節炎、強直性脊柱炎等常見風濕性疾病的規范診治，更強調對少見風濕性疾病、風濕性疾病重要臟器損害以及風濕性疾病嚴重并發癥的綜合診治，追求更精 確的診斷、更細致的評估、更有效的治 療效果。
面對眾多前來求助的風濕病患者，北京協和醫院風濕免疫科緊抓高質量醫療服務不放松。針對門診及住院患者中的疑難病例，科室每周組織專業組查房進行集中會診；陸續開展線上診療、視頻三級查房，確保患者就醫的連續性；建立完善多個專病門診，縮短患者診療周期，改善患者就診體驗……
