北京301醫院是全軍重癥監護示范基地和中華護理學會的培訓基地。每年招收市級以上醫療機構進修醫師1200余名，接收軍隊、地方醫學院校實習生200余名。軍隊生源基本涵蓋了軍隊各兵種及武警系統130家醫院，以及各系統門診部、衛生隊、療養院等。地方生生源主要來自全國21個省、4個直轄市、5個自治區1500家三級以上醫院和醫學院，約占全國三級醫院的65.2%。
北京301醫院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎22項，國家發明獎3項，軍隊科技進步一等獎21項。醫院承擔“973”、“863”等各類課題800多項，在中國國內、國際公開發表的論文總數和國內論文被引用次數連續4年居全國醫院之首。
令狐恩強率先定名完善消化內鏡隧道技術，模糊了消化內外科的界限，替代了一批傳統外科手術；率先提出基于保持人體解剖結構不變條件下，達到祛除疾病目的的超級微創手術新概念，替代長期存在以切除器官為代價的手術模式，為未來手術方法學與器械研發指明了方向。
令狐恩強為中國逆行胰膽管造影（ERCP）規范的出臺做出了積極的貢獻，為中國消化道早癌的內鏡下技術的完善與普及做了大量工作，為中國的內鏡下早癌切除躋身世界先進行列做出了積極的貢獻。
